MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp28-4

Total Repeats: 372

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017234	TTAAT	2	10	1	10	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017234	ATTAA	2	10	39	48	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017234	TA	3	6	108	113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017234	ATA	3	9	126	134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017234	A	7	7	158	164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017234	A	6	6	196	201	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017234	A	6	6	228	233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017234	A	6	6	238	243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017234	A	6	6	259	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017234	GCA	3	9	321	329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017234	GAT	2	6	337	342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017234	TAT	2	6	346	351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017234	ATC	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017234	A	6	6	376	381	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017234	CTTAAA	2	12	382	393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017234	AAAG	2	8	421	428	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017234	TAG	2	6	498	503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017234	ATT	2	6	509	514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017234	T	6	6	513	518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017234	A	6	6	549	554	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017234	ATT	2	6	578	583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017234	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017234	A	7	7	599	605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017234	ATT	2	6	629	634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017234	A	6	6	662	667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017234	AAT	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017234	AATA	2	8	727	734	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017234	A	6	6	778	783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017234	A	6	6	797	802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017234	ATA	2	6	814	819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017234	A	6	6	819	824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017234	TGT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017234	ATAC	2	8	869	876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017234	GAG	2	6	882	887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017234	A	6	6	1589	1594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017234	TAT	2	6	1598	1603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017234	TAA	2	6	1619	1624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017234	TTTA	2	8	1652	1659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017234	GAA	2	6	1660	1665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017234	ATTA	2	8	1682	1689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017234	TATAT	2	10	1730	1739	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017234	ATTT	2	8	1742	1749	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017234	T	6	6	1758	1763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017234	TA	3	6	1770	1775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017234	AC	3	6	1845	1850	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017234	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_017234	T	6	6	1869	1874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017234	T	6	6	1896	1901	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017234	A	6	6	1928	1933	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017234	TTA	2	6	1935	1940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017234	TA	3	6	1939	1944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017234	TTA	2	6	1954	1959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017234	TAT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017234	ACAAGA	2	12	1996	2007	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017234	T	6	6	2093	2098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017234	TCT	2	6	2103	2108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017234	TAAT	2	8	2132	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017234	ATTA	2	8	2155	2162	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017234	TAAC	2	8	2238	2245	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017234	T	6	6	2315	2320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017234	ATA	2	6	2333	2338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017234	ATTA	2	8	2401	2408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017234	AT	3	6	2412	2417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017234	ATT	2	6	2479	2484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017234	TA	4	8	2492	2499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017234	AAT	2	6	2507	2512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017234	ATA	2	6	2525	2530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017234	TAT	2	6	2547	2552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017234	TAC	2	6	2594	2599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017234	TATG	2	8	2607	2614	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017234	TAA	2	6	2686	2691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017234	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017234	AG	3	6	2726	2731	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017234	AAG	2	6	2751	2756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017234	TAAA	2	8	2760	2767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017234	A	6	6	2773	2778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017234	ACT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017234	A	6	6	2797	2802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017234	AC	3	6	2820	2825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017234	TA	3	6	2837	2842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017234	TTA	2	6	3388	3393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017234	AT	3	6	3436	3441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017234	TTA	2	6	3460	3465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017234	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017234	A	7	7	3550	3556	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017234	CCT	2	6	3638	3643	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_017234	AATTA	2	10	3687	3696	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017234	AT	3	6	3774	3779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017234	TAT	2	6	3810	3815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017234	TA	3	6	3834	3839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017234	T	7	7	3865	3871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017234	AAT	2	6	3909	3914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017234	AAT	2	6	3958	3963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017234	A	7	7	3982	3988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017234	ATT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017234	TAT	2	6	4029	4034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017234	ATTA	2	8	4104	4111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017234	A	6	6	4118	4123	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017234	T	7	7	4166	4172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017234	TAA	3	9	4192	4200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017234	AATT	2	8	4211	4218	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017234	T	6	6	4287	4292	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017234	AT	3	6	4308	4313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017234	AT	3	6	4321	4326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017234	TTA	2	6	4368	4373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017234	ACT	2	6	4383	4388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017234	ATT	2	6	4446	4451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017234	T	7	7	4531	4537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017234	TTAA	2	8	4547	4554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017234	TCA	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017234	TTA	2	6	4600	4605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017234	C	6	6	4612	4617	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017234	A	6	6	4685	4690	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017234	AT	3	6	4750	4755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017234	A	6	6	4769	4774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017234	AT	3	6	4805	4810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017234	TAA	2	6	5509	5514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017234	A	6	6	5556	5561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017234	GAA	2	6	5564	5569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017234	ATC	2	6	5593	5598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017234	TTA	2	6	5632	5637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017234	AT	5	10	5679	5688	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017234	TTA	2	6	5700	5705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017234	ATT	2	6	5728	5733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017234	AAT	2	6	5749	5754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017234	TAAC	2	8	5805	5812	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017234	A	6	6	5818	5823	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017234	TTA	2	6	5824	5829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017234	ACC	2	6	5831	5836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_017234	AAAATT	2	12	5859	5870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017234	T	7	7	5902	5908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017234	TAA	2	6	5915	5920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017234	A	7	7	5919	5925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017234	AC	3	6	5933	5938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017234	ATG	2	6	5979	5984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017234	T	6	6	6008	6013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017234	ACT	2	6	6039	6044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017234	AAT	2	6	6103	6108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017234	TAAT	2	8	6145	6152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017234	T	7	7	6195	6201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017234	CTTTT	2	10	6217	6226	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_017234	TTA	2	6	6231	6236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017234	ATT	2	6	6278	6283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017234	T	6	6	6348	6353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017234	AAT	2	6	6375	6380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017234	ATT	2	6	6407	6412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017234	GTT	2	6	6416	6421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017234	T	7	7	6420	6426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017234	ATA	2	6	6457	6462	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017234	TA	3	6	6461	6466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017234	A	6	6	6482	6487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017234	TA	3	6	6494	6499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017234	ATT	2	6	6506	6511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017234	TAA	2	6	6573	6578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017234	TTA	2	6	6602	6607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017234	T	8	8	6656	6663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017234	TTG	2	6	6701	6706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017234	TTA	3	9	6732	6740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017234	T	7	7	6759	6765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017234	TAT	2	6	6774	6779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017234	AAAT	2	8	6919	6926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017234	GTA	2	6	6963	6968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017234	A	7	7	10556	10562	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_017234	A	6	6	10882	10887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_017234	GTA	3	9	14860	14868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017234	TA	3	6	14867	14872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017234	GCT	2	6	14893	14898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
309	NC_017234	T	6	6	14898	14903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017234	T	7	7	14911	14917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_017234	T	8	8	15061	15068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017234	T	8	8	15082	15089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017234	T	6	6	15119	15124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_017234	AT	3	6	15134	15139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017234	TAT	2	6	15141	15146	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_017234	AT	3	6	15184	15189	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
317	NC_017234	CTT	2	6	15208	15213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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319	NC_017234	AT	3	6	15231	15236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
320	NC_017234	ATT	2	6	15288	15293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_017234	ATT	2	6	15324	15329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_017234	ATA	3	9	15389	15397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_017234	TTA	3	9	15399	15407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
324	NC_017234	CTT	2	6	15457	15462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
325	NC_017234	T	7	7	15471	15477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_017234	T	6	6	15507	15512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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330	NC_017234	A	6	6	19495	19500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
331	NC_017234	A	6	6	19515	19520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
332	NC_017234	ATT	2	6	19544	19549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_017234	AAG	2	6	19769	19774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
335	NC_017234	ATTT	2	8	19822	19829	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
336	NC_017234	T	6	6	19827	19832	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
337	NC_017234	AATT	2	8	19833	19840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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340	NC_017234	T	6	6	21095	21100	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
341	NC_017234	TTAA	2	8	21141	21148	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
342	NC_017234	ATT	3	9	21154	21162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
343	NC_017234	AT	4	8	21167	21174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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347	NC_017234	TA	3	6	21223	21228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
348	NC_017234	A	7	7	21290	21296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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351	NC_017234	TA	3	6	21353	21358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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357	NC_017234	TTCT	2	8	21508	21515	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
358	NC_017234	TGA	2	6	21518	21523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
359	NC_017234	AGAAA	2	10	21524	21533	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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367	NC_017234	TGAT	2	8	22114	22121	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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372	NC_017234	A	6	6	22360	22365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.